两种等位基因的表达差异是由花青素编码基因b上游kb序列的染色质状态决定的;当BI基因上游序列处于活化状态，能够与b启动子区域相互作用，而发挥增强子的功能，使b在叶鞘和苞叶中大量表达;当B’基因上游增强子处于失活状态，b基因只能低水平转录;b基因上游kb处（BI和B’基因处）含有个bp单元的重复序列，RNA介导的RNA聚合酶对重复序列甲基化而使目的基因失活从而失去增强子作用